وزارت‌خارجه افغانستان اعلام کرد رژیم ایران اسناد شواهد و مدارک ارائه شده غرق شدن مهاجران افغان توسط پاسداران مرزی رژیم که توسط کمیساریای مرزی افغانستان تهیه شده بود را قبول نکرد و کشتن و غرق کردن افغانها را تکذیب کرده است.
گران هیواد، سخنگوی وزارت‌خارجه افغانستان گفت: بر اساس مفاد موافقت‌نامه میان دو کشور تحقیق به مراجع دیپلماتیک واگذار می‌شود. وی گفت: کمیساریای افغانستان بر اساس موافقت‌نامه اسناد و مدارک را به مراجع دیپلماتیک سپرده است.
محمد حمید طهماسی، رئیس هیأت تحقیق افغانستان روز شنبه ۲۷اردیبهشت در گفتگو با رئیس‌جمهوری افغانستان گفته است این حادثه بر اساس اسناد، مدارک، شواهد، ویدیوها، تصاویر و اقرار آسیب دیدگان از نگاه فنی، حرفه‌یی و حقوقی و هم‌چنان بر مبنای اسناد، کنوانسیون‌ها، لوایح بررسی شده است.
طهماسی در خصوص یافته‌های خود گفته که ۴۶شهروند افغانستان وارد خاک ایران شده بودند که از این تعداد ۱۲نفر کشته، ۱۷نفر ناپدید است و ۱۷تن دیگر نیز نجات یافته است. او گفته که قربانیان از ولایت‌های هرات و فاریاب هستند.
هم‌چنین ۲۵۰تن از اساتید دانشگاه و فعالان سیاسی و حقوق‌بشری روز ۲۷اردیبهشت در بیانیه‌یی اعلام کرده‌اند که جنایت رخ داده علیه مهاجران افغان توسط مرزبانان رژیم ایران از سوی رسانه‌ها و یک نهاد مستقل تأیید شده و رژیم ایران به‌دنبال اتلاف وقت و لاپوشانی است.
تحقیق حول جنایت رژیم ایران در قتل عام مهاجران افغانی
- خاطرنشان می‌شود که رسانه‌های افغان در روز ۱۱اردیبهشت اخباری مبنی بر این‌که که حدود ۵۰ مهاجر که به سمت ایران می‌رفتند، توسط گارد مرزی ایران دستگیر و شکنجه شده و سپس به رودخانه که بین دو کشور جریان دارد، انداخته شدند را منتشر کردند.این گزارشات که بر اساس مستندات مصاحبه با بازماندگان و فیلمهایی از کشته‌شدگان بود بازتاب گسترده‌یی در مطبوعات داشت.این گزارشات شامل کلیپ‌های تلفن موبایل است که دهها جسد را نشان می‌دهد که در رودخانه غرق شده‌اند.عبدالواحد، ۲۰ساله، که یکی از بازماندگان است در یک مصاحبهٔ تلفنی گفت: آنها به زدن ما با لوله ادامه دادند و گفتند به کشور ما برنگردید و ما را به داخل رودخانه هل دادند.. .
